06月14 動物研究百邁客云解決方案-BMKCloud_數(shù)據(jù)庫收錄的豬屬數(shù)據(jù)所涉及研究方向
解決方案概述
針對動物基因組學研究，百邁客云可通過BMKCloud_數(shù)據(jù)庫模塊向用戶提供海量的動物高通量測序公共數(shù)據(jù)，借助公共數(shù)據(jù)，可大幅降低研究成本，提升研究層次。數(shù)據(jù)檢索、下載、保存均在圖形化界面下完成，避免了傳統(tǒng)模式中，須在命令行界面下進行數(shù)據(jù)下載、格式轉換等一系列繁瑣操作的限制，完全適用于國內生信0基礎的用戶。
對于公共數(shù)據(jù)的下游分析，百邁客云目前已實現(xiàn)公共數(shù)據(jù)模塊與分析模塊的無縫對接，用戶可直接將已保存至用戶目錄的數(shù)據(jù)直接導入BMKCloud_APP分析模塊進行下游分析，該模塊同樣采用圖形化操作界面，無需用戶掌握任何編程基礎，高度集成化專業(yè)化的分析流程可保證用戶快速完成對數(shù)據(jù)的基礎分析以及必要的數(shù)據(jù)深度挖掘。
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整合mRNA公共測序數(shù)據(jù)，構建豬肉品質相關miRNA-mRNA調控網絡
方案實現(xiàn)過程
1）進入BMKCloud_數(shù)據(jù)庫模塊進行數(shù)據(jù)檢索與保存。
2）進入BMKCloud_APP模塊，簡單5步完成公共數(shù)據(jù)or自測數(shù)據(jù)導入及任務投遞。
3）分析結果自動生成，繼續(xù)使用個性化分析模快速完成數(shù)據(jù)深度挖掘。
BMKCloud_數(shù)據(jù)庫收錄的豬屬數(shù)據(jù)所涉及研究方向：
疾病類研究：豬多系統(tǒng)衰竭綜合征、豬生殖呼吸道綜合征、支氣管哮喘、豬偽狂犬病、豬弓形蟲病、全反式維甲酸&抗病、豬圓環(huán)病毒感染、鼠傷寒沙門菌感染、口蹄疫病毒感染、豬巨細胞病毒感染、脊髓損傷……
生長發(fā)育類研究：繁殖力、同胎生仔數(shù)、胚胎發(fā)育、豬卵巢發(fā)育、生長速度、豬肉品質、食欲、脂肪組織發(fā)育、肌肉組織發(fā)育、豬背最長肌分化……
其他：基因組組裝、環(huán)境適應、遺傳進化……
文章思路
Khan FA et al. ? Analysis of Bos taurus and Sus scrofa X and Y chromosome transcriptome highlights reproductive driver genes. ? Oncotarget. 2017
百邁客云實現(xiàn)方案
